В статье рассматриваются теоретико-методологические основы формирования инновационного человеческого капитала (ИЧК) в контексте регионального развития и функционирования национальной инновационной системы (НИС). Показано, что качественный уровень ИЧК является важнейшим условием повышения технологической конкурентоспособности, обеспечения устойчивости социально-экономических систем и интенсификации инновационной активности. Определены ключевые параметры и уровни формирования ИЧК - индивидуальный, корпоративный и региональный, - а также описаны механизмы его развития через взаимодействие различных субъектов НИС. В исследовании предложена оригинальная методика оценки уровня ИЧК на основе комплексного подхода, включающего построение интегрального индекса, корреляционно-регрессионный анализ взаимосвязей между структурными компонентами капитала, а также факторный анализ с использованием индексного метода. Выделены концептуальные и инструментальные принципы, лежащие в основе эффективного управления ИЧК на региональном уровне. Разработана модель управления, охватывающая образовательный, организационный и территориальный уровни, а также система показателей, ориентированных на оценку условий и результатов формирования ИЧК. Полученные результаты направлены на создание прикладного инструментария, способного обеспечить принятие обоснованных управленческих решений в сфере формирования ИЧК.