EISSN 2686-8482

· Язык: ru

Статья: МОЛЕКУЛЯРНЫЙ СКРИНИНГ АЛЛЕЛЕЙ РЕЗИСТЕНТНОСТИ 08 TO-F, RCA2 И RPF1 В ГИБРИДНОМ ПОТОМСТВЕ ЗЕМЛЯНИКИ САДОВОЙ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ ФОРМ С КОМПЛЕКСНОЙ УСТОЙЧИВОСТЬЮ К ГРИБНЫМ ПАТОГЕНАМ (2024)

Читать

Читать онлайн

Устойчивость к грибным патогенам - одно из важнейших направлений селекции земляники садовой ( Fragaria ×ananassa Duch.). Генетически детерминированная устойчивость позволит минимизировать использование химических средств защиты и повысит качество получаемой продукции. В настоящем исследовании представлены результаты молекулярного скрининга гибридных сеянцев земляники садовой по локусам резистентности к мучнистой росе ( 08 To-f ), антракнозу ( Rca2 ) и фитофторозу ( Rpf1 ) для идентификации форм с комплексной устойчивостью к этим патогенам. В анализируемых комбинациях скрещивания количество сеянцев, совмещающих в генотипе локусы устойчивости 08 To-f и Rpf1, варьировало от 9.3 % (Былинная × Фейерверк) до 30.3 % (Олимпийская надежда × Былинная) при среднем по комбинациям значении 17.2 %. В комбинации скрещивания Былинная × Олимпийская надежда генотип 08 To-f + Rpf1 имеют сеянцы 61-5 и 61-6; в комбинации Былинная × Фейерверк - сеянцы 62-6, 62-33, 62-34, 62-41; в комбинации Олимпийская надежда × Былинная - гибриды 65-1, 65-8, 65-11, 65- 14, 65-16, 65-17, 65-21, 65-22, 65-30, 65-35; в комбинации Привлекательная × Былинная - формы 72-17, 72-27, 72-35, 72-59, 72- 88; в комбинации Фейерверк × Былинная - сеянцы 69-5, 69-6, 69-7, 69-8, 69-11, 69-35, 69-36, 69-40, 69-47. Количество сеянцев с генотипом 08 To-f + Rca2 составило 18.7 % в комбинации Malwina × Tea (гибриды 3/4-2, 3/4-8, 3/4-17, 3/4-23, 3/4-24, 3/4-31) и 27.5 % в комбинации Florence × Faith (гибриды 3/9-3, 3/9-6, 3/9-11, 3/9-22, 3/9-24, 3/9-25, 3/9-28, 3/9-30, 3/9-33, 3/9-34, 3/9-40). Среднее количество гибридов с генотипом 08 To-f + Rca2 по комбинациям составило 23.1 %. Указанные сеянцы являются перспективными генетическими источниками комплексной устойчивости к мучнистой росе и фитофторозу, мучнистой росе и антракнозу.

Ключевые фразы: fragaria ×ananassa duch, устойчивость, мучнистая роса, АНТРАКНОЗ, фитофтороз, молекулярные маркеры

Автор (ы): Лыжин Александр Сергеевич, Лукъянчук Ирина Васильевна

Журнал: ПИСЬМА В ВАВИЛОВСКИЙ ЖУРНАЛ ГЕНЕТИКИ И СЕЛЕКЦИИ

Предпросмотр статьи

Идентификаторы и классификаторы

УДК: 001.6. Научные знания

Для цитирования:

ЛЫЖИН А. С., ЛУКЪЯНЧУК И. В. МОЛЕКУЛЯРНЫЙ СКРИНИНГ АЛЛЕЛЕЙ РЕЗИСТЕНТНОСТИ 08 TO-F, RCA2 И RPF1 В ГИБРИДНОМ ПОТОМСТВЕ ЗЕМЛЯНИКИ САДОВОЙ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ ФОРМ С КОМПЛЕКСНОЙ УСТОЙЧИВОСТЬЮ К ГРИБНЫМ ПАТОГЕНАМ // ПИСЬМА В ВАВИЛОВСКИЙ ЖУРНАЛ ГЕНЕТИКИ И СЕЛЕКЦИИ. 2024. Т. 10 № 2

Текстовый фрагмент статьи

Список литературы

1. Айтжанова С.Д., Орехова Г.В. Селекционная оценка исходных форм земляники на устойчивость к мучнистой росе. Плодоводство и ягодоводство России. 2009;22(1):206-212. EDN: KXWOAP
Aytzhanova S.D., Orekhova G.V. Breeding assessment of initial strawberry forms for powdery mildew resistance. Plodovodstvo i Yagodovodstvo Rossii = Pomiculture and Small Fruits Culture in Russia. 2009;22(1):206-212 (in Russian). EDN: KXWOAP
2. Андронова Н.В. Наследование устойчивости к белой пятнистости в гибридном потомстве земляники садовой. Плодоводство и ягодоводство России. 2019;56:106-111. DOI: 10.31676/2073-4948-2019-56-106-111 EDN: ZDRKYX
Andronova N.V. Inheritance of resistance to white spot in hybrid offspring of garden strawberry. Plodovodstvo i Yagodovodstvo Rossii = Pomiculture and Small Fruits Culture in Russia. 2019;56:106-111. 10.31676/2073-4948-2019-56-106-111 (in Russian). DOI: 10.31676/2073-4948-2019-56-106-111(inRussian) EDN: ZDRKYX
3. Говорова Г.Ф., Говоров В.Н., Говоров Д.Н. Использование селекционно-генетического метода в защите земляники от болезней и вредителей. Известия Тимирязевской сельскохозяйственной академии. 2008;2:53-60. EDN: JTCTFZ
Govorova G.F., Govorov V.N., Govorov D.N. Selective-genetic method use in protection of garden strawberries from pests and diseases. Izvestiya Timiryazevskoy Selskokhozyaystvennoy Akademii = Izvestiya of Timiryazev Agricultural Academy. 2008;2:53-60 (in Russian). EDN: JTCTFZ
4. Жученко А.А. Биологизация и экологизация интенсификационных процессов в сельском хозяйстве. Вестник ОрелГАУ. 2009;3:8-12. EDN: KKXUXX
Zhuchenko A.A. Biologization and ecologization of intensification processes in agriculture. Vestnik OrelGAU = Bulletin of Orel State Agrarian University. 2009;3:8-12 (in Russian). EDN: QLADOZ
5. Камедько Т.Н., Пугачев Р.М. Селекция земляники садовой на устойчивость к антракнозу. Вестник Белорусской государственной сельскохозяйственной академии. 2018;2:130-134. EDN: XRYYBV
Kamedzko T.N., Puhachov R.M. Strawberry breeding for anthracnose resistance. Vestnik Belorusskoy Gosudarstvennoy Selskokhozyaystvennoy Akademii = Bulletin of the Belarussian State Agricultural Academy. 2018;2:130-134 (in Russian). EDN: XRYYBV
6. Лукъянчук И.В. Комплексная устойчивость земляники к белой и бурой пятнистостям. Плодоводство и ягодоводство России. 2013;36(1):366-369. EDN: PWRKZZ
Luk’yanchuk I.V. Complex strawberry resistance to white and brown spots. Plodovodstvo i Yagodovodstvo Rossii = Pomiculture and Small Fruits Culture in Russia. 2013;36(1):366-369 (in Russian). EDN: PWRKZZ
7. Лукъянчук И.В., Лыжин А.С., Козлова И.И. Анализ генетической коллекции земляники (Fragaria L.) по генам Rca2 и Rpf1 с использованием молекулярных маркеров. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2018;22(7):795-799. DOI: 10.18699/VJ18.423 EDN: YMZLJJ
Luk’yanchuk I.V., Lyzhin A.S., Kozlova I.I. Analysis of strawberry genetic collection (Fragaria L.) for Rca2 and Rpf1 genes with molecular markers. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2018;22(7):795-799. DOI: 10.18699/VJ18.423 EDN: YMZLJJ
8. Лыжин А.С., Лукьянчук И.В. Анализ полиморфизма генотипов земляники (Fragaria L.) по гену устойчивости к фитофторозной корневой гнили Rpf1 для идентификации перспективных для селекции и садоводства форм. Весцi Нацыянальнай акадэмii навук Беларусi. Серыя аграрных навук. 2020;58(3):311-320. DOI: 10.29235/1817-7204-2020-58-3-311-320 EDN: ULZPPA
Lyzhin A., Luk’yanchuk I. Analysis of polymorphism of strawberry genotypes (Fragaria L.) according to the strawberry red root spot resistance gene Rpf1 for identification of strawberry forms promising for breeding and horticulture. Vesti Natsionalnoy Akademii Nauk Belarusi. Seriya Agrarnykh Nauk = Proceedings of the National Academy of Sciences of Belarus. Agrarian Series. 2020;58(3):311-320. 10.29235/1817-7204-2020-58-3-311-320 (in Russian). DOI: 10.29235/1817-7204-2020-58-3-311-320(inRussian) EDN: ULZPPA
9. Лыжин А.С., Лукъянчук И.В. Использование ДНК-маркеров в селекции земляники садовой на устойчивость к патогенам (Sphaerotheca macularis, Colletotrichum acutatum, Phytophthora fragariae var. fragariae). Современное садоводство. 2023а;4:12-22. DOI: 10.52415/23126701_2023_0402 EDN: OUQZDW
Lyzhin A.S., Luk’yanchuk I.V. The use of DNA markers in strawberry breeding for pathogen resistance. Sovremennoye Sadovodstvo = Contemporary Horticulture. 2023а;4:12-22. 10.52415/23126701_2023_0402 (in Russian). DOI: 10.52415/23126701_2023_0402(inRussian) EDN: OUQZDW
10. Лыжин А.С., Лукъянчук И.В. Наследование устойчивости к антракнозу, детерминируемой доминантным геном Rca2, в гибридном потомстве земляники садовой. Таврический вестник аграрной науки. 2023б;3(35):137-144. DOI: 10.5281/zenodo.10141405 EDN: WAINBA
Lyzhin A.S., Luk’yanchuk I.V. Inheritance of anthracnose resistance determined by the dominant Rca2 gene in strawberry hybrid progeny. Tavricheskiy Vestnik Agrarnoy Nauki = Taurida Herald of the Agrarian Sciences. 2023b;3(35):137-144. 10.5281/zenodo.10141405 (in Russian). DOI: 10.5281/zenodo.10141405(inRussian) EDN: WAINBA
11. Лыжин А.С., Лукъянчук И.В. Изучение генетической коллекции земляники (Fragaria L.) по устойчивости к мучнистой росе. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2024;28(2):166-174. DOI: 10.18699/vjgb-24-19 EDN: BBAAVI
[Lyzhin A.S., Luk’yanchuk I.V. Study of a genetic collection of strawberry (Fragaria L.) for resistance to powdery mildew. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2024;28(2):166-174. DOI: 10.18699/vjgb-24-19 EDN: BBAAVI
12. Лыжин А.С., Лукъянчук И.В., Жбанова Е.В. Полиморфизм сортов земляники (Fragaria × ananassa) по гену устойчивости к антракнозу Rca2. Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. 2019;180(1):73-77. DOI: 10.30901/2227-8834-2019-1-73-77 EDN: SBDYPR
Lyzhin A.S., Luk’yanchuk I.V., Zhbanova E.V. Polymorphism of the Rca2 anthracnose resistance gene in strawberry cultivars (Fragaria × ananassa). Trudy po Prikladnoy Botanike, Genetike i Selektsii = Proceedings on Applied Botany, Genetics and Breeding. 2019;180(1):73-77. 10.30901/2227-8834-2019-1-73-77 (in Russian). DOI: 10.30901/2227-8834-2019-1-73-77(inRussian) EDN: SBDYPR
13. Марченко Л.А. Земляника садовая: оценка отечественного сортимента и направления селекции. Аграрный вестник Урала. 2020;12(203):50-60. DOI: 10.32417/1997-4868-2020-203-12-50-60 EDN: MSMLLY
Marchenko L.A. Strawberry: evolution of the domestic assortment and direction of selection. Agrarnyy Vestnik Urala = Agrarian Bulletin of the Urals. 2020;12(203):50-60. 10.32417/1997-4868-2020-203-12-50-60 (in Russian). DOI: 10.32417/1997-4868-2020-203-12-50-60(inRussian) EDN: MSMLLY
14. Марченко Л.А. Методы и способы исследований для решения задач селекции земляники садовой (аналитический обзор). Вестник КрасГАУ. 2021;9(174):59-68. DOI: 10.36718/1819-4036-2021-9-59-68 EDN: TCVITT
Marchenko L.A. Strawberry: evolution of the domestic assortment and direction of selection (analytical review). Vestnik KrasGAU = Bulletin KrasSAU. 2021;9(174):59-68. 10.36718/1819-4036-2021-9-59-68 (in Russian). DOI: 10.36718/1819-4036-2021-9-59-68(inRussian) EDN: TCVITT
15. Пикунова А.В. Оценка генетического разнообразия исходного и селекционного материала ягодных культур с помощью молекулярных маркеров: Дис. … канд. биол. наук. СПб., 2011. EDN: QFZMLP
Pikunova A.V. Assessment of Genetic Diversity of Source and Breeding Material of Berry Crops Using Molecular Markers. PhD thesis. St. Petersburg, 2011 (in Russian). EDN: QFZMLP
16. Храбров И.Э., Антонова О.Ю., Шаповалов М.И., Семенова Л.Г. Молекулярный скрининг сортовой коллекции земляники ВИР на наличие маркера гена устойчивости к антракнозной черной гнили Rca2. Биотехнология и селекция растений. 2021;4(4):15-24. DOI: 10.30901/2658-6266-2021-4-o3 EDN: LVGPMW
Khrabrov I.E., Antonova O.Yu., Shapovalov M.I., Semenova L.G. Molecular screening of the VIR strawberry varieties collection for the presence of a marker for the anthracnose black rot resistance gene Rca2. Biotekhnologiya i Selektsiya Rasteniy = Plant Biotechnology and Breeding. 2021;4(4):15-24. 10.30901/2658-6266-2021-4-o3 (in Russian). DOI: 10.30901/2658-6266-2021-4-o3(inRussian) EDN: LVGPMW
17. Barbey C.R., Lee S., Verma S., Bird K.A., Yocca A.E., Edger P.P., Knapp S.J., Whitaker V.M., Folta K.M. Disease resistance genetics and genomics in octoploid strawberry. G3: Genes Genomes Genetics. 2019;9(10):3315-3332. DOI: 10.1534/g3.119.400597 EDN: WNXZIT
18. Gorgitano M.T., Pirilli M. Life cycle economic and environmental assessment for a greening agriculture. Calitatea. 2016;17(S1):181-185.
19. Haymes K.M., Van de Weg W.E., Arens P., Maas J.L., Vosman B., Den Nijs A.P.M. Development of SCAR markers linked to a Phytophthora fragariae resistance gene and their assessment in European and North American strawberry genotypes. J. Amer. Soc. Hort. Sci. 2000;125(3):330-339. DOI: 10.21273/JASHS.125.3.330
20. Keldibekova M., Bezlepkina E., Zubkova M., Dolzhikova M. DNA-screening of strawberry cultivars and hybrids (Fragaria ananassa Duch.) for resistance to fungal diseases. Pak. J. Bot. 2024;56(2):29. DOI: 10.30848/PJB2024-2(29) EDN: PTJQUY
21. Khan A.H., Hassan M., Khan M.N. Conventional plant breeding program for disease resistance. In: Plant Disease Management Strategies for Sustainable Agriculture through Traditional and Modern Approaches. Sustainability in Plant and Crop Protection. Vol. 13. Springer, 2020;27-51. DOI: 10.1007/978-3-030-35955-3_3
22. Koishihara H., Enoki H., Muramatsu M., Nishimura S., Susumu Y.U.I., Honjo M. Marker associated with powdery mildew resistance in plant of genus Fragaria and use thereof. Patent No. US 10,724,093 B2. Washington, DC: U.S. Patent and Trademark Office, 2020.
23. Lerceteau-Kohler E., Guerin G., Denoyes-Rothan B. Identification of SCAR markers linked to Rca2 anthracnose resistance gene and their assessment in strawberry germplasm. Theor. Appl. Genet. 2005;111:862-870. DOI: 10.1007/s00122-005-0008-1 EDN: FSYSSD
24. Lyzhin A., Luk’yanchuk I. Marker controlled screening of resistant to red stele root rot (Rpf1 gene) strawberry selected forms. BIO Web Conf. 2021;36:01006. DOI: 10.1051/bioconf/20213601006 EDN: GTJGCQ
25. Miller-Butler M.A., Smith B.J., Kreiser B.R., Blythe E.K. Comparison of anthracnose resistance with the presence of two SCAR markers associated with the Rca2 gene in strawberry. Hortic. Sci. 2019;54(5):793-798. DOI: 10.21273/HORTSCI13805-18
26. Njuguna W. Development and Use of Molecular Tools in Fragaria. PhD thesis. Oregon State University, 2010.
27. Sturzeanu M., Coman M., Ciuca M., Ancu I., Cristina D., Turcu A.G. Molecular characterization of allelic status of the Rpf1 and Rca2 genes in six cultivars of strawberries. Acta Hortic. 2016;1139:107-112. DOI: 10.17660/ActaHortic.2016.1139.1
28. Sturzeanu M., Calinescu M., Fralova L., Klakotskaya N., Ancu I., Sumedrea M., Marin F.C. Assessing some strawberry genotypes used in breeding programme for increasing resistance to diseases. Fruit Growing Res. 2017;33:29-34.
29. Sturzeanu M., Ciuca M., Cristina D., Turcu A.G. Use of RAPD and SCAR markers for identification of strawberry genotypes with red stele resistance genes Rpf1 and fruit rot resistance genes Rca2 in the hybrid progenies. Acta Hortic. 2021;1309:93-100. 10.17660/Acta Hortic.2021.1309.15. DOI: 10.17660/ActaHortic.2021.1309.15 EDN: VWFGER
30. Whitaker V.M. Applications of molecular markers in strawberry. J. Berry Res. 2011;1:115-127. DOI: 10.3233/BR-2011-013
31. Whitaker V.M., Knapp S.J., Hardigan M.A., Edger P.P., Slovin J.P., Bassil N.V., Hytönen T., Mackenzie K.K., Lee S., Jung S., Main D., Barbey C.R., Verma S. A roadmap for research in octoploid strawberry. Hortic. Res. 2020;7:33. DOI: 10.1038/s41438-020-0252-1 EDN: GAQQNS

Выпуск

Т. 10 № 2 (2024)

Кол-во страниц: 131 страница

Другие статьи выпуска

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ СИСТЕМЫ ЦМС-RF В ГИБРИДНОЙ СЕЛЕКЦИИ ПОДСОЛНЕЧНИКА (2024)

Авторы: ТРУБАЧЕЕВА НАТАЛИЯ ВИКТОРОВНА, САЛИНА ЕЛЕНА АРТЕМОВНА, Шумный Владимир Константинович

Подсолнечник является важнейшей масличной культурой во многих регионах мира благодаря широкой адаптивности к различным агроклиматическим условиям и типам почв, высокому качеству масла, содержанию белка. Доступность цитоплазматической мужской стерильности (ЦМС), наряду с источниками восстановления фертильности, привела к использованию гетерозисных гибридов в качестве основной технологии возделывания подсолнечника для промышленных целей. К задачам гетерозисной селекции подсолнечника относится создание гибридов, обладающих высокой продуктивностью и комплексной устойчивостью к биотическим и абиотическим стрессовым факторам. Почти все коммерческие гибриды подсолнечника основаны на одном типе ЦМС - PET1, что обусловливает их высокую генетическую однородность и уязвимость к воздействию меняющихся условий среды. Расширение генетического разнообразия родительских линий и выявление альтернативных систем ЦМС- Rf, а также разработка и апробация молекулярных маркеров, сцепленных с генами-восстановителями фертильности и специфичных для различных типов цитоплазм, считаются одной из актуальных задач для развития технологии гибридной селекции подсолнечника. Данный обзор посвящен рассмотрению теоретических и практических вопросов, связанных с использованием системы ЦМС- Rf в селекции подсолнечника, молекулярно-генетических основ признаков мужской стерильности и восстановления фертильности, и достижений в области молекулярного маркирования данных признаков.

Сохранить в закладках

УНИКАЛЬНЫЙ СИБИРСКИЙ ГЕНОФОНД РЖИ И ЕГО ИСПОЛЬЗОВАНИЕ В СЕЛЕКЦИИ ЗЕРНОВЫХ КУЛЬТУР (2024)

Авторы: СТЁПОЧКИН ПЁТР ИВАНОВИЧ, Ермошкина Наталья Николаевна, АРТЁМОВА ГАЛИНА ВАСИЛЬЕВНА, МУСИНОВ КЕНЖЕБЕК КУНАЕВИЧ, СУРНАЧЁВ АЛЕКСЕЙ СЕРГЕЕВИЧ

В статье представлены данные по исследованию и использованию сибирского генофонда ржи для создания сортов озимой ржи, получения озимой тритикале и трансгрессивных форм озимой мягкой пшеницы, превышающих стандартные сорта по урожайности и другим хозяйственно важным признакам и свойствам. В результате селекционной работы созданы конкурентоспособные сорта озимой ржи двух уровней плоидности (2 n = 14, 2 n = 28), сочетающие в одном генотипе высокую зимостойкость, устойчивость к полеганию, урожайность, качество зерна, а также адаптивность к биотическим и абиотическим стрессам. Для использования в селекционном процессе в условиях Сибири наиболее перспективен сорт озимой ржи Короткостебельная 69. Путем перевода его на тетраплоидный уровень создан зимостойкий, продуктивный, устойчивый к полеганию сорт Тетра короткая, районированный по Западно-Сибирскому и Восточно-Сибирскому регионам. Использование сорта Короткостебельная 69 в отдаленной гибридизации позволило получить зимостойкие короткостебельные сорта озимой тритикале Сирс 57 и Цекад 90 с продуктивностью свыше 6.0 т/га. На основе селекционной линии тритикале ЛМК 462, включающей в родословную сорт Короткостебельная 69, создан сорт озимой мягкой пшеницы Новосибирская 3 с повышенным уровнем зимостойкости.

Сохранить в закладках

НОВАЯ-СТАРАЯ ЭПИГЕНЕТИЧЕСКАЯ ПАРАДИГМА КАНЦЕРОГЕНЕЗА (2024)

Авторы: Попова Наталья Алексеевна, НИКОЛИН ВАЛЕРИЙ ПЕТРОВИЧ, МЕРКУЛОВА ТАТЬЯНА ИВАНОВНА

На протяжении многих лет рак рассматривался как такое же универсальное заболевание, как инфекционное, метаболическое или генетическое. С момента признания открытия вируса саркомы Рауса широкое распространение получила концепция вирусного происхождения опухолей. Впоследствии выяснилось, что раковые заболевания характеризуются высоким уровнем нестабильности генома, которая связана с повышенной частотой мутаций, вызываемых как онкогенными вирусами, так и различными канцерогенными факторами. Мутационная теория оставалась основной парадигмой, объясняющей канцерогенез, обусловленный мутациями ДНК. Однако еще много лет назад предполагалось, что опухолевый фенотип вполне может сформироваться также и за счет эпигенетических изменений. Исследования, проведенные за последние годы, продемонстрировали важность эпигенетических механизмов на различных стадиях развития рака, что явилось основанием для признания эпигенетической дисрегуляции при раке ключевым фактором злокачественности. Эпигенетические изменения модифицируют хроматин и механизмы, влияющие на регуляцию генов без изменения последовательности нуклеотидов в ДНК. Эти механизмы, включая широкий круг процессов, таких как метилирование ДНК, посттрансляционные модификации гистонов и регуляция, опосредованная некодирующими РНК, модулируют биологические события, которые имеют решающее значение для развития рака. Многие из признаков рака (злокачественное самообновление, блокада дифференцировки, уклонение от гибели клеток и тканевая инвазия) находятся под глубоким влиянием изменений в эпигеноме. Растущее количество фактических данных свидетельствует о том, что механизмы эпигенетической модификации, нарушенные при раке, могут быть мишенями при лечении онкозаболеваний.

Сохранить в закладках

МИТОХОНДРИАЛЬНЫЙ ГЕНОМ EISENIA ALTAICA (LUMBRICIDAE, ANNELIDA) (2024)

Авторы: ЗУБКО КИРИЛЛ СЕРГЕЕВИЧ, ШЕХОВЦОВ СЕРГЕЙ ВИКТОРОВИЧ, ЛЕОНОВ П.А., ЮРЛОВА Г.В., ПОЛУБОЯРОВА ТАТЬЯНА ВЛАДИМИРОВНА, ВАСИЛЬЕВ ГЕННАДИЙ ВЛАДИМИРОВИЧ, Шипова Анна Александровна, ГОЛОВАНОВА ЕЛЕНА ВАСИЛЬЕВНА

Дождевой червь Eisenia altaica (Perel, 1968) - один из узкоареальных эндемиков Алтая. Он обитает на севере Республики Алтай в долине р. Катунь. В данном исследовании мы получили образцы E. altaica с юга Алтайского края. Мы секвенировали ДНК образца E. altaica методом Illumina, собрали и проанализировали его митохондриальный геном. Митохондриальный геном собран в виде непрерывного контига длиной 15,248 п. н. Он содержал типичный для дождевых червей набор генов, кодирующих белки, рибосомальную и транспортную РНК. Все гены располагались на одной цепи ДНК. AT-состав митохондриального генома (за исключением АТ-тракта) - 62.7 %. Белок-кодирующие гены nd4 и nd4l перекрывались на 7 пар нуклеотидов. Выявлено, что ATG является единственным старт-кодоном. Шесть белок-кодирующих генов ( cox1, atp8, cox3, nd6, nd1 и nd2 ) обладали укороченным стоп-кодоном (Т’). Филогенетический анализ, проведенный для видов рода Eisenia на основании полных митохондриальных геномов, показал, что виды E. altaica и E. tracta родственны к одной из ветвей линий комплекса E. nordenskioldi ( E. nor-denskioldi sensu stricto ). Это указывает на необходимость дробления комплекса E. nordenskioldi. Также близость алтайских эндемиков к комплексу E. nordenskioldi может свидетельствовать о том, что центр видообразования сибирской ветви рода Eisenia находится на Алтае. Контрольный регион мтДНК содержит тракт микросателлита АТ длиной более 150 п. н., который не мог быть собран полностью. Мы провели поиск микросателлитов в митохондриальных геномах других видов дождевых червей и обнаружили, что микросателлит АТ встречается в контрольных регионах представителей других видов, родов и семейств дождевых червей, в то время как другие микросателлиты там не найдены, что указывает на особую роль именно этого типа повторов в функционировании контрольных регионов.

Сохранить в закладках

Издательство

Издательство: НИИТПМ
Регион: Россия, Новосибирск
Почтовый адрес: 630089, г. Новосибирск, ул. Б. Богаткова, 175/1, Метро "Золотая нива", Автобус "Молодежная, Кошурникова"
Юр. адрес: 630090, г. Новосибирск, пр-т Академика Лаврентьева, 10
ФИО: Рагино Юлия Игоревна (Руководитель)
Контактный телефон: +7 (383) 3730981
Сайт: https://iimed.ru/

Все права на тексты и товарные знаки принадлежат их законным владельцам. Подробнее...

Сайт https://scinetwork.ru (далее – сайт) работает по принципу агрегатора – собирает и структурирует информацию из публичных источников в сети Интернет, то есть передает полнотекстовую информацию о товарных знаках в том виде, в котором она содержится в открытом доступе.

Сайт и администрация сайта не используют отображаемые на сайте товарные знаки в коммерческих и рекламных целях, не декларируют своего участия в процессе их государственной регистрации, не заявляют о своих исключительных правах на товарные знаки, а также не гарантируют точность, полноту и достоверность информации.

Все права на товарные знаки принадлежат их законным владельцам!

Сайт носит исключительно информационный характер, и предоставляемые им сведения являются открытыми публичными данными.

Администрация сайта не несет ответственность за какие бы то ни было убытки, возникающие в результате доступа и использования сайта.

Спасибо, понятно.